연어과 어류의 3종 바이러스 동시 검출 multiplex PCR 진단법 개발 및 검증
Development and validation of a multiplex PCR assay for simultaneous detection of three salmonid fish viruses
- 발행기관 강릉원주대학교 일반대학원
- 지도교수 도움말 홍수희
- 발행년도 2024
- 학위수여년월 2024. 8
- 학위명 석사
- 학과 및 전공 도움말 일반대학원 수산생명의학과
- 실제URI http://www.dcollection.net/handler/kangnung/000000011966
- UCI I804:42001-000000011966
- 본문언어 한국어
목차 도움말
1. 서론 3
2. 재료 및 방법 11
2.1. 바이러스의 준비 11
2.2. RNA 분리 및 cDNA 합성 16
2.3. 염기서열 분석. 18
2.4. Primer 디자인 18
2.5. Single PCR 분석 20
2.6. 양성 대조군 구축 24
2.7 최소한계 검출 27
2.8. Multiplex PCR 진단법 최적화 27
2.8.1. GC meltⅠ, Ⅱ, Betaine 시약추가 28
2.8.2. dNTP 농도 28
2.9. 분석 민감도 28
2.10. 분석 특이도 29
2.11. 진단 민감도 및 진단 특이도 31
2.12. 재현성 분석 33
3. 결과 35
3.1. 염기서열 비교 35
3.2. Primer 검증 41
3.3. Single PCR 최소 한계 검출 43
3.4. Multiplex PCR 조건 최적화 46
3.4.1. 결합 온도 46
3.4.2. GC melt I and II, Betaine 47
3.4.3. dNTP 농도 48
3.5. Multiplex PCR의 분석 민감도 49
3.6. Multiplex PCR의 분석 특이도 53
3.7. Multiplex PCR의 진단 민감도 56
3.8. Multiplex PCR의 진단 특이도 59
3.9. Multiplex PCR의 재현성 63
4. 고찰 67
4.1. 염기서열 비교 67
4.2. Primer 설계 및 검증 69
4.3. Multiplex PCR의 최적화 69
4.4. Multiplex PCR의 응용 70
5. 참고 문헌 73
